в 18-19 вв. создавалась на период боевых действий во время войн с Турцией. Впервые создана в 1771 П. А. Румянцевым во время русско-турецкой войны 1768-1774 под названием Лиманской гребной флотилии. В 1774 расформирована. Во время русско-турецкой войны 1787-91 Лиманская флотилия (с декабря 1790 называлась Черноморский гребной флот) под командованием контр-адмирала Н. С. Мордвинова, а затем генерал-майора О. М. де Рибаса действовала совместно с сухопутными войсками под Кинбурном, Мачином, Браиловом и при взятии Измаила и Очакова. В период русско-турецкой войны 1877-78 Д. в. ф. (1-2 канонерские лодки, 4-10 паровых минных катеров и несколько пароходов) успешно действовала против сильной турецкой флотилии на Дунае. В 1879 часть кораблей была передана Болгарии. В 1-й мировой войне 1914-1918 отряд катеров Д. в. ф. поддерживал русские войска Румынского фронта. В ноябре 1917 моряки Д. в. ф. перешли на сторону Советской власти. После захвата Бессарабии Румынией корабли ушли в феврале 1918 в Одессу, где были захвачены австро-германскими интервентами.
17 июня 1940 в связи с воссоединением Молдавии с СССР была создана Д. в. ф. с главной базой в Измаиле в составе 5 мониторов, 22 бронекатеров, 30 катеров-тральщиков, 7 сторожевых кораблей и др. В начале Великой Отечественной войны 1941-1945 совместно с войсками Южного фронта Д. в. ф. отражала попытки румынских войск форсировать Дунай. В связи с отходом советских войск перебазировалась в июле в Одессу, затем Николаев и Херсон, обеспечивала переправы через Южный Буг и Днепр, в сентябре 1941 прорвалась в Севастополь, а в октябре перешла в Керчь. 21 ноября 1941 расформирована. До 16 сентября 1941 командующим был контр-адмирал Н. О. Абрамов, затем контр-адмирал А. С. Фролов.
14 апреля 1944 была вновь сформирована и базировалась сначала в Днепровско-Бугском лимане, затем на Одессу, а с августа 1944 на Измаил. В августе 1944 насчитывала 33 бронекатера, 7 минных катеров, 8 тральщиков. Командующим Д. в. ф. был контр-адмирал С. Г. Горшков, с 12 декабря 1944 - контр-адмирал Г. Н. Холостяков. Взаимодействуя с войсками 2-го и 3-го Украинских фронтов, Д. в. ф. участвовала в Ясско-Кишинёвской операции, форсировании Дуная и овладении портами Сулин, Тульча и Измаил, в освобождении Болгарии, Югославии, Венгрии, Чехословакии и Австрии. Провела огромную работу по тралению Дуная (уничтожено до 600 мин), высадила 21 десант (свыше 27 тыс. чел.), перевезла около 1 млн. чел., свыше 1500 танков, свыше 5000 орудий и др. Награждена орденами Красного Знамени, Нахимова 1-й степени и Ушакова 1-й степени. После войны расформирована.
Лит.: Вьюненко Н. П., Мордвинов Р. Н., Военные флотилии в Великой Отечественной войне, М., 1957; Локтионов И. И., Дунайская флотилия в Великой Отечественной войне (1941-1945 гг.), М., 1962.